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ANÁLISIS DE LA
VARIABILIDAD GENÉTICA EN RAZAS EQUINA AUTÓCTONAS ESPAÑOLAS DETECTADA MEDIANTE
MICROSATÉLITES Memoria presentada en el año 2004 por María Luisa
Checa Cortés para optar al grado de Doctor, realizada en el Departamento de
Producción Animal de la Facultad de Veterinaria de la Universidad Complutense
de Madrid y codirigida por la Dra. Susana Dunner y por el Dr. Miguel Vallejo,
cuyos objetivos eran: 1.- Cuantificar y comparar los niveles de
variabilidad genética en las razas analizadas. 2.- Estimar las relaciones genéticas entre las razas autóctonas
españolas que están histórica y geográficamente próximas. 3.- Valorar la capacidad del conjunto de
microsatélites empleado, como herramienta con la que poder asignar muestras
anónimas a alguna de las razas analizadas en este estudio. En este estudio se analizaron un total de 540
animales pertenecientes a ocho razas diferentes (Figura 4.1.), cinco de las
cuales se encuentran dispersas por diversas zonas del norte de la península
(Asturcón (AST), Losina (LOS), Pottoka (PT), Caballo de Pura Raza Gallega
(CG) y Jaca Navarra (JN)), dos pertenecen al archipiélago balear (Mallorquina
(MAL) y Menorquina (MEN)), y una última raza, que se introdujo como grupo de
referencia (outgroup) (Pura Sangre Inglés (PSI)). Las muestras de la raza Losina, provienen de un solo
núcleo geográfico, enclavado en la localidad de Pancorbo, y gestionado por
Ricardo de Juana. En relación a la raza losina se destacan los siguientes datos: El alelo 92 es exclusivo de la raza Losina, con una
frecuencia del 0,8%. El resto de frecuencias alélicas presenta una
distribución muy similar entre todas las razas analizadas. Distancias
genéticas entre razas y su representación gráfica. Entre las razas atlánticas, la topología del clado
Asturcón es la más robusta (84% de los animales del cluster, dentro de la
raza), probablemente por el mayor esfuerzo invertido para preservar esta raza
durante las últimas décadas, ya que el Libro Genealógico creado en 1981 es el
más antiguo de todas las razas descritas. La raza Losina, que también muestra
un claro agrupamiento (80% de los animales agrupados juntos), es un caso
especial, ya que hoy existe un solo rebaño en manos de un único criador. La distancia genética más baja fue la encontrada
entre las poblaciones Caballo de Pura Raza Gallega con Jaca Navarra y Pottoka
(0,07). Losina y Pura Sangre Inglés (usado como grupo de
referencia) son las dos poblaciones genéticamente más distantes.
Medidas de
similitud entre individuos. En cuanto a las medidas de similitud entre
individuos, el resultado de aplicar la distancia de Bowcock a los 262
animales seleccionados, fue una matriz de 262x262, en la que cada fila y
columna corresponde a un individuo. Mediante el programa MEGA la matriz se
trató con el método de agrupamiento UPGMA y se generó el árbol de la Figura
5.25
Las razas que mostraron estar mejor agrupadas fueron
Asturcón, Losina, Menorquina, Mallorquina y Pura Sangre Inglés. El resto de
razas no se definen específicamente en un clado, sino que se muestran
entremezcladas entre ellos. Asignación
racial. En el análisis por raza, la raza Pura Sangre Inglés,
es la que presenta mayor porcentaje de éxito, con un 0% en los dos tipos de
error estimados. En cuanto a las razas autóctonas y considerando tan solo los
resultados obtenidos con el método Bayesiano, la raza Losina coincide en
presentar los porcentajes de error más bajos. Las razas Asturcón, Losina, Mallorquina y Menorquina,
son las razas más diferenciadas del resto y también las que menos porcentaje
de error muestran en la asignación racial, al margen de la raza Pura Sangre
Inglés. En la determinación del porcentaje de error en la asignación racial se usaron dos
métodos: el de frecuencias y el Bayesiano. En ambos análisis el error tipo I presenta los
porcentajes más altos en las razas Caballo de Pura Raza Gallega, Pottoka, y
Mallorquina, mientras que el porcentaje de error tipo II más alto es para las
razas Caballo de Pura Raza Gallega, Pottoka y Jaca Navarra. Con el método Bayesiano es la raza Losina la que
cuenta con el error tipo II más bajo, es decir que es más difícil asignar un
individuo de esta raza, elegido aleatoriamente, a otros grupos raciales, o
dicho a la inversa, es más fácil adscribir correctamente a un individuo de
esta raza a su propio grupo. En el análisis por parejas, el microsatélite con
mayor porcentaje de éxito ha sido HMS6 en 11 de las 20 combinaciones, con
valores entre el 83,24% y el 95,35%. Este último caso es el de las razas
Losina y Mallorquina, lo que demuestra el alto poder de discriminación de
este marcador en estas dos razas. Un dato muy relevante es que, dentro de las razas del
tronco atlántico, la pareja con mayor porcentaje de éxito en los valores de
asignación correcta, corresponde a las razas Losina y Pottoka, con un 98,29%. Heterocigosis Los valores de heterocigosis observada y esperada
también fueron similares entre todas las razas analizadas siendo el valor
medio de Ho de 72%, sorprende la similitud entre los valores encontrados en
las razas Asturcón, Losina, Jaca Navarra y Caballo de Pura Raza Gallega, las
cuales además de contar con diferencias notables entre sus censos, se han gestionado
de forma muy diferente desde el punto de vista reproductivo. En el caso de
Asturcón y Losina, el control de cruzamientos ha sido más estricto que en las
otras dos razas, ya que la raza Asturcón cuenta con un Libro genealógico
desde el año 1981 y la raza Losina está gestionada bajo el criterio de un
solo criador, mientras que Jaca Navarra y Caballo de Pura Raza Gallega
cuentan con Libros Genealógicos mucho más recientes y además en el segundo
caso el sistema productivo extensivo, con suelta de los animales al monte
durante todo el año, no permite un control de los cruces. Los valores de FIS permiten detectar si una población
tiene defecto o exceso de heterocigotos. Las razas Jaca Navarra, Caballo de
Pura Raza Gallega, Pottoka y Raza Mallorquina, muestran valores indicativos
de un déficit de heterocigotos, destacando especialmente Caballo de Pura Raza
Gallega, que tiene déficit de heterocigotos para todos los microsatélites
excepto dos, y que se puede explicar por niveles de endogamia altos como
consecuencia de cruzamientos no aleatorios, lo que contrasta con el régimen
de explotación de la raza, que se desarrolla en extensivo. Por tanto, parece
más probable que el origen del déficit de heterocigotos esté en una
subestructuración reproductiva (efecto Wahlund) al igual que ocurre en el
resto de las razas con déficit de heterocigotos. Implicaciones
para la conservación de la diversidad genética. Desde la perspectiva de pérdida de la diversidad y en
cuanto a las razas peninsulares cantábricas, la situación más grave vendría
dada por la desaparición de la raza Losina ya que acumula un 42% de la
diversidad genética de esta agrupación, seguida del Asturcón (34%) y Jaca
Navarra (30%) |
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